一、幼树

幼树修剪的中心任务是培养树形 ： 3年生以下的幼树可在距地面40 ～ 60厘米处将苗梢剪去，剪口下留旺盛的侧枝作为骨干枝。落叶后选留3个主枝，位置错开，分布均匀，主枝上下间隔15厘米左右，与主干呈40°～ 50°角。

二、初挂果幼龄树

该期整形和结果并重，修剪宜轻，一般不要短截，只进行撑、拉和曲枝处理，留好骨干枝，剪去多余枝，基部萌发枝条留3 ～ 5个，其余从基部剪去。

三、结果树

结果树的修剪以维持树势，培养和调整结果枝组为目的，可用长果枝带头，使树冠保持在一定范围内，适当疏剪外围枝。骨干枝的枝头下垂时，应及时回缩，用斜生枝复壮枝头，及时疏剪交叉枝、枯死枝和病虫枝。

四、盛果期树

修剪时应注意维持主枝间平衡，抑强扶弱，以更新及控制结果部位为主，每年在落叶后应及时疏除枯死枝，回缩更新老果枝，以保持树体旺盛的结果能力。对于大枝过多、树形紊乱的要先疏去部分大枝，然后剪去对当年抽生的营养枝先端半木质化部分，留中部花芽充实的部分，一般剪去枝条1/3左右。对于隐芽萌发的徒长枝，若内膛较空，可培养成结果枝组，如内膛枝过密，则应疏除。要加强结果母枝的复壮，以保证旺枝结果，提高结果能力。尽管花椒结果母枝连续结果能力较强，但连续结果3 ～ 5年后，仍有明显衰弱现象，应及时回缩复壮或利用壮枝更新。
修剪时应坚持去弱留强，疏弱芽留壮芽。
修剪时应注意疏除影响光照的多余枝，保持良好的通风透光条件，对过密、细弱、交叉、重叠、徒长及病虫枝，要及时疏除，使冠内枝组健壮、均衡生长，防止后部光秃。

花椒树不耐修剪，一次性去除大枝过多，容易导致严重抽条甚至死树，因此修剪时应尽量少去大枝，修剪后剪口处要涂抹油漆或愈合剂，以防抽条。修剪时要保持剪口平滑，不要留橛，以免发生萌条。花椒多以中短枝结果为主，修剪方法应以疏剪为主，不宜过多短截。
主枝先端衰弱者，要回缩至壮枝处，并选留向上或斜生枝作带头枝。

五、衰老树

首先清除病虫枝、枯干枝，然后修剪内向枝、交叉枝、重叠枝，最后把树冠周围每一枝条顶部剪去10厘米。老树和弱树的修剪，以更新复壮为主，兼顾重缩或疏除弱小枝组，充分利用徒长枝，补充残缺树冠，保留适量结果枝。