资料｜ceRNA调控网络构建TCGA数据库（内含代码）

ceRNA全称competing endogenous RNA，是一种能够竞争结合RNA的作用元件。通常lncRNA和circRNA会竞争结合miRNA，我们一般把lncRNA和circRNA可以称作ceRNA。ceRNA调控网络全称ceRNA regulation network，指的是有ceRNA参与的整个调控网络。而ceRNA分析指的是对整个ceRNA调控网络进行分析。一般有circRNA-miRNA-mRNA分析或lncRNA-miRNA-mRNA分析。

ceRNA分析流程图

由于ceRNA机制研究的套路较为固定，调控网络的预测相对简单，实验也并不复杂，因此近年来非编码RNA的研究大多从ceRNA机制研究这一角度着手，相关文章数量出现井喷式增长，这势必导致ceRNA机制研究落入俗套，出现ceRNA研究难发高分文章的现象。

但是高分文章基本上都是遵循着生信数据挖掘+实验验证，这样的一个研究套路，比如lncRNA，然后在确定lncRNA之后顺藤摸瓜找到lncRNA sponge的miRNA以及靶向miRNA的mRNA，最终确定lncRNA-miRNA-mRNA这一ceRNA调控网络，当然这中间的各种验证实验是必不可少的。

目录一览：

第一章、TCGA数据库简介

第二章、软件安装

第三章、数据下载提取

第四章、差异分析

第五章、差异IncRNA与差异miRNA比对

第六章、DEmiRNA靶基因预测

第七章、网络构建数据准备

第八章、构建ceRNA网络

第九章、生存分析

部分展示 领取请看文末

做有价值的研究，幸福科研人生，欢迎关注启帆医学BioSCI,添加科研小助理，备注头条粉丝即可免费获取。

公众号专注于生物医学研究、科研课题设计、SCI论文写作等领域的知识梳理和资料分享，为广大医务工作者提供便利。