干细胞和器官研究中发现尼安德特人DNA

允许人类诱导多能干细胞 (iPSC) 系转化为类器官的方案改变了科学家研究发育过程的方式，使他们能够破译基因和组织形成之间的相互作用，特别是对于没有原发组织的器官。现在，研究人员正在采用这项技术，并将其应用于研究尼安德特人DNA的发育效应。

该研究结果于 6月18日发表在《华尔街日报》上

使用iPSC细胞株研究功能古老的人类DNA未开发但非常有趣的方法，”资深作者说J.德国马克斯·普朗克进化人类学研究所和瑞士巴塞尔大学的灰色阵营。“从来没有人能够看到尼安德特人的DNA在发育过程中所扮演的角色。"

研究发现，来自非洲以外的现代人约 2% 的基因组由尼安德特人的DNA组成。这种古老的DNA是几千年前两组交配的结果。

在这项新的研究中，该团队使用了来自人类诱导多能干细胞倡议 (HipSci) 的资源，这是一个为研究提供数据和细胞系的国际联盟。HipSci中几乎所有的数据和细胞系都来自英国和北欧血统。研究人员分析了这种细胞系资源的尼安德特人DNA含量，并为每种细胞系注释了尼安德特人的功能变体。

“一些尼安德特人等位基因在这一人群中具有相对较高的频率，” 坎普解释道。“正因为如此，这个iPSC资源包含了某些对尼安德特人等位基因纯合子的基因，包括与欧洲人高度流行的皮肤和头发颜色相关的基因。"

Camp的团队使用五个细胞系生成脑器官，并生成单细胞RNA测序数据来分析它们的细胞组成。他们表明，该转录组数据可用于跨发育过程跟踪尼安德特人衍生的RNA。坎普说: “这是一项主证研究，表明你可以利用这些资源来研究尼安德特人DNA在发育过程中的活性。”。“真正的挑战将是在一次实验中增加行数，但这已经开始成为可能。"

Camp指出，这项研究可以扩展到研究其他古代人类群体，包括Denisovans，它们的基因主要存在于大洋洲人群中。他的团队还计划利用HipSci等资源继续研究尼安德特人的等位基因。“类器官可用于研究由尼安德特人DNA控制的许多不同发育过程和表型，包括肠道和消化、认知和神经功能以及对病原体的免疫反应，” 他总结道。