明朝时新疆是个什么状态？

处于化外之邦的地位，且混乱。

　　明朝在中国封建王朝中，是一个最奇怪的存在。新疆被伊斯兰化，就是从明朝开始的。从朱元璋、朱棣之后，后面几乎就没有出过什么管事的皇帝，后来出了个万历新政，也主要是张居正干的，几百年江山浑浑噩噩就混过来了。混到崇祯这个勤政、励精图治的皇帝手里，明朝却灭亡了。新疆当时还不叫新疆，叫西域。元朝灭亡后，管辖东疆的元朝肃王兀纳失里投降明朝，明朝封其为忠顺王，在此地建设哈密卫。从此后兀纳失里的后裔均被封为忠顺王或者忠义王，并由明朝派来的汉人充当长史辅佐外加监视，这个半独立的附庸政权被称为哈密国。

　　实际上统治大部分新疆地区的是察合台汗国，察合台汗国在元朝末年分裂，西部中亚地区被巴鲁剌思部，速勒都思部，札剌亦儿部，乃蛮部等原本是蒙古人的突厥化的部落掌控，察合台汗国由此分裂为中亚的西察合台汗国和南疆的东察合台汗国。在分裂过程中东察合台蒙古贵族开始全盘伊斯兰化，其大汗也开始采用了速檀称号。西察合台汗国不久之后就被出身巴鲁剌思氏的驸马帖木儿给篡夺了，这个帖木儿是个不安分的家伙，喜欢东征西讨，很快拿下了东察合台汗国。并控制了伊尔汗国的旧有领土，夺取了早已分裂的金帐汗国的大片领土，准备东征明朝，还没走出察合台汗国的疆域，他就一命呜呼了。对明朝来说，不知道是祸还是福。

　　帖木儿死后，生前统治的区域全盘分裂，继承领土最多的沙哈鲁开始给明朝朝贡。东察合台汗国也摆脱了帖木儿帝国的附庸地位，开始恢复入贡明朝。后来又迁都亦力把里，也就是伊犁，因为又被明朝换了称呼，从别失八里改成了亦力把里。 东察合台汗国此后又开始了发展，不但大力推行伊斯兰教，还开始向瓦剌部用兵，甚至夺取了中亚一些帖木儿后裔的领土，并开始武力征讨哈密国。

　　东察合台的君主阿黑麻曾多次击败瓦剌人，为了吞并哈密国，阿黑麻迁都吐鲁番，这时候明朝又改他们的名字叫了土鲁番，后世也常将该国俗称吐鲁番汗国。 阿黑麻的儿子满速尔最终吞并了哈密国，因为我明朝对这些藩属的不重视，土鲁番吞并哈密国后，明朝没有采取干预措施，只是封锁了商路。结果不但没让满速尔害怕，反倒让满速尔入侵明朝，导致明朝一度放弃了嘉峪关以西的所有领土。

　　于是土鲁番开始在哈密国强行推行伊斯兰教。导致最后一批坚持不信伊斯兰教的畏兀儿人东逃明朝融入明朝境内的黄头回鹘，和黄头回鹘最终形成了裕固族。 阿黑麻还有一个儿子叫赛德，占领了喀什，建立了叶尔羌汗国。传了几代之后，吐鲁番汗国在瓦剌蒙古和叶尔羌汗国的夹击之下亡国。 赛德的哥哥巴布尔，被表弟攻击的无路可走，逃到了印度，居然也征服了印度，建立了莫卧儿帝国。

　　赛德由于早年命运多舛，所以十二分虔诚地笃信伊斯兰教，尤其是信仰黑山派的和卓。黑山派的和卓非常得势，就不断打压白山派。 叶尔羌汗国后期，白山派的著名和卓阿帕克和卓被笃信黑山派的叶尔羌汗国君主驱逐出国。阿帕克和卓非常生气， 借助五世达赖喇嘛的关系，与信奉黄教的葛尔丹联手征讨叶尔羌汗国， 新疆从此被准格尔汗国统治，一直到被清朝消灭。这就是明朝的新疆，如果明朝的皇帝们有一点儿作为的话，新疆可能不一定伊斯兰化，当然也就不会有土木堡之变了。

明朝时期的新疆，其实一部完整的东察合台汗国史。只不过明朝并没有用察合台来称呼东察合台汗国，而是简单粗暴的用它的首都名称来命名它的国号。比如亦力把里、别失八里，给人一种很陌生的感觉。其实不管怎么叫，都是东察合台汗国。

蒙古崛起后，成吉思汗吞并了西辽。他将西辽故地一分为三，最大的一块分封给了自己的次子察合台，较小的一块分给了后来继承大汗的三儿子窝阔台，新疆东部的哈密地区被单独划出，直接归蒙古中央管理。后来忽必烈建立元朝，在新疆设立过三个行省，但都没有持续很久，分别被察合台汗国和伊利汗国瓜分。元朝的势力也就退出了新疆中西部，只保留东部的哈密地区。再后来察合台汗国吞并了窝阔台汗国，新疆进入了察合台汗国时代。而元朝则继续领有哈密地区，元朝和察合台汗国的这一领土划分，也影响了后来的明朝政府对西域的领土主张。

元朝时期，元朝和察合台的关系非常差，双方打了几十年。元末起义时，察合台汗国完全不把元朝当作自己的蒙古同胞兄弟。看到起义军造反，它也乘机出兵打元朝。后来徐达和常遇春北伐大都，元顺帝出逃，元朝就此灭亡。

元朝灭亡后，明朝一时还没有接管元朝的所有领土。乘这个机会，察合台汗国变本加厉的攻打哈密，企图并吞哈密。看到察合台汗国如此丧心病狂，原本管理西域哈密地区的元朝肃王兀纳失里便投降了明朝，表示愿意为明朝镇守西大门，抵御察合台汗国的侵蚀。明朝接受了哈密的归附请求，封兀纳失里为忠顺王，直接在哈密设立哈密卫。从此后，兀纳失里的后裔均被明朝封为忠顺王或者忠义王，并由明朝派来的汉人充当长史辅佐外加监视。这个半独立的附庸政权被称为哈密国，如果连同明朝在附近设立的其它六个卫所，这个地区也被称为关西七卫。

关西七卫与明朝以嘉峪关为界，明军基本上不会越过嘉峪关。在明朝早期，如果关西七卫遭到其它蒙古部落的攻打，明朝会派兵支援，到了中后期，明朝国势衰落，也就不怎么管这七个附庸国的死活了。

再说统治大部分新疆的察合台汗国。这个政权在元朝末年也分裂了。汗国的西部，也就是中亚地区，被巴鲁剌思部、速勒都思部和札剌亦儿部，等突厥化的蒙古部落掌控，被称为西察合台汗国。新疆部分则被称为东察合台，两部形成对立。元朝灭亡时，东察合台汗国乘机占了元朝在西域的军事重镇别失八里城，并以此为国都之一。所以在明朝初期，东察合台汗国被明朝称为别失八里。注意了，是东察合台被称为别失八里，与西察合台无关。

备注：别失是地名，八里是突厥语，翻译成汉语就是城的意思。所以别失八里的意思就是别失城。

那么西察合台汗国在干嘛呢？很惨，被帖木儿所征服，沦为了帖木儿帝国的一部分。这个帖木儿就是后来东征西讨，牛逼哄哄，号称要攻打大明的妄人。只不过他还没有出征就在中亚挂了。在帖木儿时期，东察合台汗国也臣服于臣服他。也就是说，在明朝成祖时期，西域基本上是帖木儿的势力范围。

帖木儿死后，他的帝国迅速分裂，继承领土最多的沙哈鲁也没有争霸世界的雄心，开始入贡明朝。东察合台汗国在摆脱了帖木儿帝国的附庸地位后，也开始恢复入贡明朝。后来迁都亦力把里（现在的伊犁），因此又被明朝换了称呼，从别失八里改成了亦力把里。其实就是原来的东察合台汗国。

备注：亦力是伊犁的谐音，把里也是八里的谐音。所以亦力把里的意思是伊犁城。

东察合台汗国此后开始养精蓄锐，在西域大力推行伊斯兰教，现在新疆的伊斯兰化，就是当时形成的。在恢复了一些实力后，东察合台汗国开始摩拳擦掌，向瓦剌部和帖木儿的后裔先后用兵，占了不少领土。在实力大增之后，东察合台汗国准备开始武力征讨关西七卫。但是伊犁离哈密太远了，为了吞并哈密，东察合台的大汗阿黑麻将首都从伊犁迁到了吐鲁番。所以明朝的史书上又把东察合台汗国的名字给改了，改叫土鲁番汗国。

哈密国在抵挡一阵后，向明朝求援。当时的明朝皇帝是嘉靖，这皇上整天忙于炼丹，对哈密这个附属国懒得搭理。最后哈密王开城投降向吐鲁番投降，嘉峪关以西的所有羁縻卫所全部被吐鲁番汗国吞并。吐鲁番汗国的势力达到了最巅峰。

但是常言道，巅峰过后必是低谷。吐鲁番大汗有个弟弟叫赛依德，他因为跟他的大汗哥哥有仇，然后就向西逃到了帖木儿后裔，也就是他表哥巴布尔那里避难。可是没想的是，他刚逃到表哥那里，结果巴布尔统治的国家也朝不保夕了。当时在中亚兴起了一个叫布哈拉的突厥王朝，这个布哈拉汗国四处扩张，打的周边汗国哭爹喊娘。巴布尔就是哭爹喊娘的其中一份子。

备注：布哈拉人就是现在的乌兹别克人

在布哈拉汗国的大军压境之下，巴布尔抵挡不住，便跟赛依德说，干脆我们兵分两路跑路算了，我率一路南下，去印度找出路，你率一路向东，去找你哥，诚心诚意的多磕几个头，让他宽恕你。塞依德的内心瞬间有十万匹草泥马奔腾，但是没办法，实在是打不过人家。最后这俩表兄弟就在极其悲壮的情况下分头找出路去了。

巴布尔南下之后，发现印度阿三真的是一帮垃圾，轻轻松松吊打，于是他也不客气，指挥他的几千残兵败将，直接就把印度当地的土著政权给灭了，建立了印度历史上的莫卧儿王朝。

赛依德向东出发，一开始是抱着乞求他亲哥饶他一命的心态。结果没想到，塞依德刚刚进入吐鲁番汗国的境内，吐鲁番汗国的喀什地区就叛乱了。于是赛德对着巴依尔送他的几千残兵败将讲，你们都已经是丧家之犬了，难道还怕死么？跟我来，眼前就有一座喀什城，里面有大把的美酒美食和美女，只要你们听我的，拿下喀什，城里面的宝物就都是你们的，因为我是吐鲁番前任大汗的儿子，这座城我是有权继承的！于是在赛依德的刺激下，他带的几千哀兵很快就占领了喀什，并以喀什为基地不断向亲哥进攻。屡战屡胜，最后居然还建立了叶尔羌汗国。与他哥哥的吐鲁番汗国分据新疆的东西两部，新疆也进入了叶尔羌和吐鲁番对峙时期。

差不多到了嘉靖中期，塞依德乘吐鲁番与瓦剌开战之机，率兵突袭吐鲁番，结果居然一举灭了吐鲁番汗国。于是新疆进入了叶尔羌汗国独霸时期。

但是叶尔羌汗国的实力很弱，它名义上统治新疆，实际上很多地方都管不到。中亚的哈萨克汗国瞅准了机会，乘机进入了新疆。漠北草原瓦剌也看准了叶尔羌汗国很弱，有几个部落便进入了新疆的北部地区。于是新疆西北的哈萨克汗国、新疆北部的瓦剌和硕特部、新疆南部的叶尔羌汗国形成了三足鼎立之势，一直到了明朝灭亡都没有结束这个对峙局面。

总的来说，明朝时期的新疆，基本上就是察合台汗国的历史，贯穿了明朝的始末。在这个时期，新疆没有一天是统一的。先是察合台汗国分裂，接着帖木儿帝国下克上，反克了东、西察合台汗国。帖木儿死后，察合台汗国短暂统一了新疆。然而再次分裂，从之中分裂出来叶尔羌汗国再次下克上，灭了吐鲁番汗国。在叶尔羌和吐鲁番内战期间，瓦剌的和硕特部和哈萨克汗国的势力也进入了西域。双方形成了三足鼎立之势，一只持续到了清朝康熙时期。

最后再把三大汗国的结尾也交代一下。

三个汗国对峙了几十年后，大概是在明朝崇祯后期，叶尔羌汗国开始大搞宗教迫害，汗国内部的伊斯兰教分成黑山派和白山派，大汗尊崇黑山派，导致黑山派得势，不断打压白山派的教众。于是白山派的领袖就被驱逐出了国，跑到西藏求盟友，企图颠覆叶尔羌汗国。最后他游荡了很长时间，找到了一个非常奇葩的盟友——五世达赖喇嘛。

五世达赖自己并没有强大的力量，他是没有能力推翻叶尔羌汗国的。但是达赖喇嘛有不少学生，其中有一个学生叫噶尔丹。这个人就不用多说了吧。当时噶尔丹也想吞并叶尔羌，他在吞并了和硕特的其它部落后，建立了准噶尔汗国，并将哈萨克汗国击败使之臣服于自己，基本上独霸了新疆的北部。

到了清朝康熙时期，信奉佛教的噶尔丹和信奉伊斯兰教的叶尔羌白山派联手，一举灭了叶尔羌汗国，统一了新疆。新疆自此结束了察合台汗国将近四百年的统治，进入了准格尔汗国时代，一直到七十五后，准噶尔汗国被乾隆皇帝所灭。新疆也自唐朝中后期分裂出去后，再次纳入中原王朝的版图。

新疆古称西域，自公元前60年汉宣帝设西域都护府起这里就已被纳入中华版图神圣不可分割的领土之中，直到南北朝时期兴起于阿尔泰山的突厥人征服了这里，使中原地区同西域的联系一度被切断，但在大唐灭东、西突厥后重新在西域地区设立安西都护府和北庭都护府等行政机构进行管辖。公元755年安史之乱爆发，安西驻军东调内地平叛，早已对西域虎视眈眈的吐蕃并没直接进攻唐朝在西域地区的安西四镇，而是出兵侵占了河西走廊。河西走廊是连接中原和西域的咽喉要道，这一地区的失守意味着大唐的西域军团被切断了同中原内地的联系，从而成为一支彻彻底底的孤军。然而令吐蕃出乎意料的是已成为孤军的西域留守军团却是一块难啃的硬骨头，事实上西域守军的顽强不仅出乎吐蕃人的意料，连李唐朝廷也对此始料不及：公元780年已是安史之乱后第25个年头，此时安史之乱早已平定，大唐天子已由玄宗换成肃宗再换成代宗继而又换成德宗，在经历频繁的变迁后人们似乎早已忘却大唐在遥远的西域还有一直孤军一直在坚守，然而就是在这年北庭都护府守将李元忠、安西都护府守将郭昕派遣使者间道奏事，至此朝廷才知道这支已失去所有补给援助的孤军，这支被认为早已葬身沙漠的孤军竟已独自坚守了25年。唐德宗对西域军团的忠贞进行了嘉奖。西域军团的传奇并未就此终结，事实上在此之后他们又独自坚守10年，直到德宗贞元六年（790年）吐蕃攻占北庭，而唐朝在西域所设的另一都护府安西也从史籍上消失了。安西都护府最终沦陷的时间目前已无从考证，但一支孤军独自坚守35年以上这本身就是一段传奇。随着安西都护府的陷落，西域同中原的联系再次断绝。

西域同中原的联系断绝后在今天新疆的土地上先是被吐蕃占据，后来逐渐兴起了伊斯兰化的喀喇汗国。1041年喀喇汗国正式分裂为东西两部，1134年东喀喇汗国的阿赫马德汗死后其子易卜拉欣汗不得人心，造成康里人和葛逻禄人叛乱，被迫邀请被金军大败而逃难至此的契丹人耶律大石出兵协助平乱。耶律大石很快平定了康里和葛逻禄，并把东喀喇汗国降为附庸，割取其北疆一带为自己的直辖领地。当年耶律大石定都于八剌沙衮（今吉尔吉斯托克马克），改年号康国元年。耶律大石自称古儿汗即世界之王。历史上称耶律大石创建的政权为西辽或喀喇契丹帝国。天禧三十四年（1211年）耶律真鲁古外出游猎时被蒙古降将、乃蛮王屈出律以伏兵八千擒之，被迫让位。屈出律尽管沿用西辽国号，但这个政权已不是契丹耶律氏所统治的了，1218年西征的蒙古军团彻底消灭了西辽政权。随着忽必烈仿照中原汉制建立元朝后他同坚持维持旧制的蒙古宗王之间矛盾越来越多并由此最终引发了蒙古帝国的分裂——元朝和窝阔台汗国、察合台汗国、金帐汗国、伊尔汗国逐渐走上独立发展的道路。元朝在今天新疆东部的哈密地区设有卫所，而新疆绝大部分地区在当时属于蒙古四大汗国中的察合台汗国。

1321年后察合台汗国分裂为东、西两部分。1369年西察合台汗国被帖木儿帝国取代。而就在前一年明太祖朱元璋在南京称帝，建立大明王朝。同年朱元璋派遣徐达、常遇春等人率军北伐并成功攻克元大都（今北京），元顺帝逃回漠北草原，明朝取代元朝成为中原正统王朝。后来明王朝“定陕西、甘肃诸镇，嘉峪关以西置不问”——然而《明史》这句话其实有夸大的成分：当时新疆绝大部分地区的确不在明王朝的控制下，但在新疆东部的哈密地区明朝是设置有卫所的，不过后来被吐鲁番部夺走。事实上明成祖朱棣在派郑和下西洋的同时，也在积极经略西域地区：先后在嘉峪关以西设置哈密、安定、阿端、赤斤蒙古、曲先、罕东和沙州等关西七卫。那么除了关西七卫之外的新疆地区在当时是个什么状态呢？

在关西七卫的西部今天新疆地区的绝大部分在明代仍属于东察合台汗国，只不过这时史籍中更多是用亦力把里这个名字称呼东察合台汗国。1432年亦力把里分裂为亦力把里、叶尔羌和土鲁番三国

叶尔羌汗国的创始者赛依德是东察合台汗国满速尔汗的三弟，他联合另一兄长赫力烈在伊犁河谷和七河流域发动暴乱反对满速尔汗，却被满速尔汗镇压了下去，于是他逃亡到帕米尔高原并控制了费尔干盆地，后来又逃往阿富汗的喀布尔城投奔帖木儿的后裔巴布尔。在巴布尔的帮助下赛依德从中亚挥军东进，重新统一南疆，建立叶尔羌汗国。叶尔羌汗国的首都在现在的莎车，鼎盛时期的疆域包括吐鲁番、哈密、塔里木盆地：汗国版图的东方是嘉峪关、南方是西藏、西南是克什米尔、西方与乌兹别克布哈拉汗国为邻，与乌兹别克以费尔干纳谷地为界，北方以天山为界，与东察合台吐鲁番汗国相邻。在这一时期喀什噶尔、和田、阿克苏重新拓展成为商贸繁荣的城市，这些地区的绿洲农业也得到了恢复与发展。新疆各族人民的文化生活此时也取得了重大进步，维吾尔传统艺术“十二木卡姆”在热西德汗时期由汗妃阿曼尼莎汗主持整理成型，成为一个体系。叶尔羌汗国信奉伊斯兰教并逐渐形成了黑山派和白山派两大教派：白山派的支持者主要是哈萨克人，而黑山派则主要是吉尔吉斯人支持。

15世中叶土鲁番汗国吞并附近的哈刺火州、柳城，日渐强大起来的土鲁番开始同明朝争夺位于如今新疆东部的哈密等卫所。明王朝自1449年的土木堡之变后国力出现中衰迹象，尽管后来明朝又有过几次中兴，但始终无法恢复到洪武、永乐、仁宣时期的强盛局面。与此同时西蒙古瓦剌部也日渐兴起，于是在哈密地区形成了明王朝、瓦剌和土鲁番三方争夺的局面。明朝对嘉峪关以西的哈密等卫所的统治模式和内地不大一样——明朝接管这里后就让当地归附自己的蒙古人在尽忠臣服的基础上继续驻守。明成化八年土鲁番趁明王朝和瓦剌在对峙中互相削弱的天赐良机出兵攻占哈密，代表明朝驻守当地的蒙古王公罕慎向北京的大明朝廷求救，却没得到任何回复，不得已之下罕慎联合其他归附明朝的蒙古部落同土鲁番交战。在历经十年的激战后罕慎成功收复了哈密，然而仅仅一年之后土鲁番就设计擒杀罕慎，再次占领哈密。这时恰逢明王朝在明孝宗的治理下迎来短暂的中兴局面，于是明孝宗下诏书斥责土鲁番，在明朝的威胁下土鲁番被迫放弃已到手的哈密。四年后土鲁番再次发兵攻占哈密，这次明朝决定发兵教训一下这个对手，于是甘肃巡抚许进率兵挺近哈密，从土鲁番人手中收复哈密。土鲁番并未就此放弃对哈密的野心，直到王越出任明朝三边总制后屡次以重兵击败土鲁番，迫使土鲁番消停了十五年。正德八年土鲁番策反了哈密指挥使拜牙，使其携哈密重镇投降土鲁番，此后明朝再未收复过哈密。

明末由瓦剌部演化而来的卫拉特蒙古人大量进入北疆地区，形成漠西蒙古诸部，其中的准噶尔部逐渐崛起成为北疆地区最为强大的一股地缘政治势力。1670年噶尔丹成为准噶尔部的首领后利用南疆叶尔羌汗国内部白山派和黑山派之间的矛盾出兵灭掉叶尔羌汗国，准噶尔汗国成为整个新疆以及邻近的中亚地区的新主人，直到清乾隆年间准噶尔汗国被清军消灭——不过这就是后话了。

新疆被伊斯兰化，就是从明朝开始的。明朝在中国封建王朝中，是一个最奇怪的存在。从朱元璋、朱棣之后，后面几乎就没有出过什么管事的皇帝，后来出了个万历新政，也主要是张居正干的，几百年江山浑浑噩噩就混过来了。混到崇祯这个勤政、励精图治的皇帝手里，明朝却灭亡了。

回头说新疆，当时还不叫新疆，叫西域。元朝灭亡后，管辖东疆的元朝肃王兀纳失里投降明朝，明朝封其为忠顺王，在此地建设哈密卫。从此后兀纳失里的后裔均被封为忠顺王或者忠义王，并由明朝派来的汉人充当长史辅佐外加监视，这个半独立的附庸政权被称为哈密国。

实际上统治大部分新疆地区的是察合台汗国，察合台汗国在元朝末年分裂，西部中亚地区被巴鲁剌思部，速勒都思部，札剌亦儿部，乃蛮部等原本是蒙古人的突厥化的部落掌控，察合台汗国由此分裂为中亚的西察合台汗国和南疆的东察合台汗国。

在分裂过程中东察合台蒙古贵族开始全盘伊斯兰化，其大汗也开始采用了速檀（苏丹）称号。西察合台汗国不久之后就被出身巴鲁剌思氏的驸马帖木儿给篡夺了，这个帖木儿是个不安分的家伙，喜欢东征西讨，很快拿下了东察合台汗国。并控制了伊尔汗国（波斯）的旧有领土，夺取了早已分裂的金帐汗国的大片领土，准备东征明朝，还没走出察合台汗国的疆域，他就一命呜呼了。对明朝来说，不知道是祸还是福。

帖木儿死后，生前统治的区域全盘分裂，继承领土最多的沙哈鲁开始给明朝朝贡。东察合台汗国也摆脱了帖木儿帝国的附庸地位，开始恢复入贡明朝。后来又迁都亦力把里（伊犁），因为又被明朝换了称呼，从别失八里改成了亦力把里。 东察合台汗国此后又开始了发展，不但大力推行伊斯兰教，还开始向瓦剌部用兵，甚至夺取了中亚一些帖木儿后裔的领土，并开始武力征讨哈密国。

东察合台的君主阿黑麻曾多次击败瓦剌人，为了吞并哈密国，阿黑麻迁都吐鲁番，这时候明朝又改他们的名字叫了土鲁番，后世也常将该国俗称吐鲁番汗国。 阿黑麻的儿子满速尔最终吞并了哈密国，因为我明朝对这些藩属的不重视，土鲁番吞并哈密国后，明朝没有采取干预措施，只是封锁了商路。结果不但没让满速尔害怕，反倒让满速尔入侵明朝，导致明朝一度放弃了嘉峪关以西的所有领土。

于是土鲁番开始在哈密国强行推行伊斯兰教。导致最后一批坚持不信伊斯兰教的畏兀儿人东逃明朝融入明朝境内的黄头回鹘（撒里维吾尔），和黄头回鹘最终形成了裕固族。 阿黑麻还有一个儿子叫赛德，占领了喀什，建立了叶尔羌汗国。传了几代之后，吐鲁番汗国在瓦剌蒙古和叶尔羌汗国的夹击之下亡国。 赛德的哥哥巴布尔，被表弟攻击的无路可走，逃到了印度，居然也征服了印度，建立了莫卧儿帝国。

赛德由于早年命运多舛，所以十二分虔诚地笃信伊斯兰教，尤其是信仰黑山派的和卓。黑山派的和卓非常得势，就不断打压白山派。 叶尔羌汗国后期，白山派的著名和卓阿帕克和卓被笃信黑山派的叶尔羌汗国君主驱逐出国。阿帕克和卓非常生气， 借助五世达赖喇嘛的关系，与信奉黄教的葛尔丹联手征讨叶尔羌汗国， 新疆从此被准格尔汗国统治，一直到被清朝消灭。

这就是明朝的新疆，如果明朝的皇帝们有一点儿作为的话，新疆可能不一定伊斯兰化，当然也就不会有土木堡之变了。

新疆，自古以来就是我国的固有领土！

但是呢，跟明朝却几乎没啥关系！那时候的明朝与新疆地区，那是“新生活，各管各”，且明朝时不时的还要受些欺负！

明初，在嘉峪关外的哈密一带，还有七个羁糜卫所，史称关西七卫！这时候的新疆，处在东察合台汗国(1348年-1509年)的统治之下！

明成化二十三年（1487年），阿黑麻在东察合台汗国东部的吐鲁番称汗，建都吐鲁番。

1509年，东察合台汗国四分五裂，叶尔羌汗国取而代之，强大起来的叶尔羌汗国，不断加大与明王朝在哈密地区的争夺！

明嘉靖三年（公元1524年），由于明朝势力的衰弱，明朝前期设立的关西七卫全部撤入嘉峪关以内，原关西七卫所处地区全部被吐鲁番汗国侵占！

明隆庆四年（1570年），叶尔羌汗国占领吐鲁番，吐鲁番属叶尔羌汗国。

至此，嘉峪关以西之地，全部归属于叶尔羌汗国，而明朝自退守嘉峪关后，其再没有能染指新疆的实力！

也正是从这一时期开始，伊斯兰教在新疆全境迅速传播，该地区的蒙古人迅速突厥化，伊斯兰化！

后，叶尔羌汗国内部也出现严重的教派之争，称作是“黑山派”与“白山派”之争，后来双方矛盾越来越尖锐，甚至是陷入血腥的战火之中！

趁着双方矛盾不断并大打出手之机，准噶尔汗国灭亡了叶尔羌汗国！

后，准噶尔汗国又与清王朝开始了激烈的战争！