一篇文献你真的「物尽其用」了吗？听听师兄是怎么挖掘利用的

无论对于医学硕士生还是博士生，在自己科研路上，做研究的时候，文献是指导和帮助我们在科研道路上越走越远，越走越深的重要参考和帮手。

导师们也常常强调阅读文献的重要性，可是实际上，一篇文献的价值我们都挖掘到了吗？有没有物尽其用呢？

如果您自己说不清，不妨跟随师兄的视角，看看文献的价值是如何挖掘利用的！

一、实验方法整合

寻找实验方法可能是我们检索文献最重要的目的之一。

医学研究论文中，实验设置和方法对结果的获取具有重要的影响，关系到结果的可重复性。

大多数高分文章对于实验方法的写作要求比较严格，例如《cell》系列期刊、文献中方法的写作比较详细，实验的各种细节也写进去了，更有利于我们去参考。

因此，我们要寻找实验方法的时候，尽量选择这类期刊文献，仔细阅读 methods 部分，同时列出实验步骤。

此外，同一种实验，可能在不同的文章中细节也不太一样，这个时候，需要搜集同类型的文章多篇，互相比对，找出大的方向，最后完善细节。

最重要的一点，特别关注 sample information，大多时候可能由于样品实验目的不同会采用不同的处理，不能盲目摘取方法，容易导致自己实验失败。

cell 文章 methods 一般好多页

二、结论参照

要研读一篇文献，对整篇文章的结论进行分析和仔细阅读是很重要的。

这里我们能学到什么呢？

最直观的一点就是学习到文章的结论，增加了一些奇奇怪怪的知识点，也可以说是新奇的观点。

一般对于别人的结果、结论我们的利用主要体现在——帮助我们找到研究选题，所有的研究都是有缺陷的，不能十全十美，这样给了我们设计课题的机会。

寻找别人做过的科学问题，有什么还没有解决，或者有待改善的地方，都是很好的方向。

这种「大树底下好乘凉」式的课题研究师兄也见过，硕士的室友曾经就说过他们老板偏向于这样的套路，专门盯着 NCS 的研究，自己延展做的课题也取得了非常好的成果。

其他对于论文结论的利用则体现在了论文的 discussion 部分，这是每个研究不可或缺的。

除此之外，我们在学习这篇文章内容的时候，需要将自己想象成作者本人。

从第一部分结果开始到最后结束，整个过程中应该始终带着思考的态度，理清其中的逻辑关系，为什么要做，如何去解决问题，得到了第一个结果，然后能够说明啥问题，接着还要如何研究。

环环相扣，理解学术思维，训练自己的学术思维。

三、数据集的利用

每篇 SCI 文章都包含这么一个内容——data availability，对全文数据适用性的说明，或者描述了公开数据地址，主要是测序数据，或者临床样本信息。

很多研究者不太会去关注这部分内容，因为感觉和自己没关系，这其实是忽略了重要的资源。

由于师兄本人是做数据分析的，所以对这部分内容比较关注。

文章公布的这些数据我们都是可以利用的，比如，现在比较火的单细胞测序，我们自己可能实力有限，所以测得的样本较少，那么就可以寻找类似的研究，将公共数据的某些组，或者样本整合纳入自己的研究，提高研究的质量。

此外，利用公共数据进行挖掘，数据再生也是非常好的课题设计思路。之前师兄就遇到过，人的某个组织很难收集，而我又需要做这个组织的转录组，但是在数据检索后发现，已经有人收集了，而且样本量很大，样本信息齐全。

然而那个研究只是关注了新的转录本，而师兄则需要从年龄方面寻找差异，很好的利用了这个数据。

四、不被关注的隐藏信息

文献阅读有时候我们可能关注到别人好看的图，也想知道这个图是怎么画的？一般情况下作者会在 method 部分进行说明是用什么软件或者工具完成的，但是个别情况下，作者在 figure legend 中提到，如果不仔细阅读，可能就错过了。

这里我还要重点强调的一个隐藏信息，应该是很多人忽略的地方，那就是如果文章涉及到较多的数据分析的时候，作者会提供 code availability，包含了数据分析所用到的所有代码，在 github 上有详细的步骤。

师兄学习单细胞数据分析的时候就是搜了一篇 nature medicine 上的文章，跟着作者的数据一步步学习，最后掌握了。假设你看到了别人好的分析方法，自己不知道如何下手，不妨找找看有没有公开代码。

公开的都是良心作者，也是对自己文章的可重复性有信心。避免大家在网上乱投医，还要花钱！

五、作者信息

可能会有人纳闷，读文献就读文献，你管它是谁做的。然而，关注下通讯作者及其联系方式，可能成为你重要的场外求助，大多数研究者都会无私地分享和解答疑惑的。

师兄之前做课题时方法有问题，然后给一篇 NC 通讯作者发了邮件，很快他让自己的学生 (论文一作) 联系了我，并将 protocols 发给了我，真的很是感激。

而且做外泌体课题时，我还联系了外泌体领域大牛 Thery，问了些问题，她也耐心地回答了我，所以不要怯于与作者联系。

六、参考文献

别急，这里的标题「参考文献」不是结束的标志，而是需要大家关注文献的参考文献。文章中参考的文献，一般是本领域研究的集合，有些文章我们自己并没有检索到或者关注，学习参考文献中感兴趣的文章，也是对自己研究背景做一个补充，有利于自己的研究，提高对本领域的认知。

最后，用一句诗来总结本文的内容，「文章不过几页纸，深挖精髓价更高」。最后，祝愿所有研究者研究顺利！