如何把普通的两两比较图，做成顶刊文献里的样子？

随着大家作图技能日渐高升，传统的两两比较图（比如条图和箱型图）已经稍显「古朴」。今天我们就一起来学习一个两两比较的神器，分边小提琴图（Split Violin plot）。

一、小提琴图简介

在此之前，我们先复习一下普通的小提琴图。

它们长这个样子：

图 1 小提琴图

这个样子：

图 2 小提琴图

和这个样子：

图 3 小提琴图

从上面三张图中我们可以看到，小提琴图的主体和箱线图相一致。但小提琴图在分布上的信息多于箱线图，它本质上还结合了密度图所表达的分布信息，因此近几年愈加受到高分文章的青睐。

以图 3 为例，提琴图内部的小箱体图代表了四分位数范围；中心横线代表数据中位数；箱体上下竖线代表 95% 置信区间；提琴宽度代表数据分布的密度。

那么，小提琴图是如何绘制的呢？

在 Origin 绘图软件中（2018 版本及以上），自带的小提琴图绘制模板主要为以下几类（由左至右）：

1. 普通版本的小提琴图（图 1 类）

2. 包含箱体的小提琴图（图 3 类）

3. 包含数据点的小提琴图

4. 包含四分位横线的小提琴图

5. 包含数据线的小提琴图

6. 分边小提琴图（今天要讲滴 ～）

7. 半小提琴图（左半侧密度散点图，右半侧分边小提琴图）

图 4 Origin 软件截图

二、分边小提琴图绘制

普通小提琴图绘制方法与箱线图一致比较简单，这里就不在赘述。我们主要来讲解一下分边提琴图的绘制方法：

（一）数据整理：

首先，我们先来看一下 Origin 软件小提琴图的数据格式：

图 5 为传统多组小提琴图的数据格式，注意 X,Y 列标签在非分组提琴图中图中不具有意义，只需要按照组别将数据每列输入即可。

图 5 普通小提琴图

而分边提琴图需要以左边绘图数据，右边分组的形式输入数据，如：图 6 的 A 列为数据列，B 列为分组列（默认最后一列为分组列，只包含两个组），多组两组数据比较只需在 B 列左侧再添加数据即可。

图 6 分边小提琴图

（二）图片绘制：

Origin 软件更新的速度很快，每个新版本几乎都会有对既往绘图方式的优化，分边小提琴图的绘制也非常简单，只需要全选数据—点击绘图—选择分边小提琴图即可。

※注意：分边小提琴图不要求各组数目完全一致，当各列数据数目不完全相等时，只需要以数据最多的一列个数为基准，划分分组列，其他数据不够的列数直接留空即可。

图 7 分边小提琴图

（三）图片美化：

分边提琴图的美化遵循 Origin 作图的传统原则——要改哪里点哪里，即可进入设置栏一一调整。

1. 箱体颜色调整：

调整箱体颜色只需将鼠标移动至颜色区域，选择填充栏，依据需求选择单色（全图同色）/按点调整（同分组同色，一共双色）/按曲线（同列同色）即可。

图 8 箱体颜色调整

2. 线条颜色调整：

调整分边提琴图内部线条需左键双击颜色区域，打开绘图属性栏，通过调整边框颜色修改内部线条颜色。

图 9 线条颜色调整

3. 提琴宽度调整：

提琴的线条宽同样通过绘图属性栏中-间距选项调整，增大间距百分比可降低箱体宽度。

图 10 提琴宽度调整

4. 提琴箱体线条类型调整：

可通过箱体选项调整箱体及数据的显示类型，一般多选择 I 型箱体与 Perc25，75。

图 11 箱体样式

5. 提琴曲线类型：

这里是需要重点强调一下提琴的曲线类型，默认的选项是 Kernel Smooth，也就是上面我们一直展示出的提琴形状，这类曲线可以比较好的复现数据特征；

但当数据分布趋势较好，或者仅需要一个近似正态的分布趋势展示数据结果，也可选用 Weibull 或正态分布（图 12），这样做出来的图片更加平滑美观。

图 12 曲线类型

其他比较简单的其他附属功能比如连接线、线条类型、透明度等也可通过绘图属性栏自行调整，方法比较简单，在此也不再赘述。

三、分边小提琴图的适用

分边小提琴图最佳适用于多组数据，且各数据组间需要两两比较的场景。

例如：自身前后对照/性别对比/给药前后等情况，且小提琴图相较传统箱线图可提供包含分布在内的更多数据特征，但同样的也会增加冗余信息量，需要根据实际数据情况酌情选择使用。

最后，传统小提琴图也可通过 Graphpad 8.0 以上版本直接绘制，但据笔者所知，目前分边的小提琴图还是仅可通过上述的 Origin2018 以上版本，以及 R 包中的 vioplot，ggplot2 制作。

那么今天就先讲到这里，祝各位小可爱科研顺利，数据漂亮 ～