GenGIS是一款非常简便容易上手的生物地理学软件，可以用来绘制单倍型地理分布图等。下面我们就来介绍一下GenGIS的使用方法。

进入C:Program FilesRR-3.1.2bini386，把所有dll文件拷到上一层目录点击我的电脑，右键进入属性点击高级系统设置

点击环境变量

添加环境变量R_HOME，变量值C:Program FilesRR-3.1.2，并添加到下面的path中

添加环境变量R_USER，变量值C:UsersuserDocuments，并添加到下面的path中

按照下面的顺序导入数据地图、地点、序列、树或地图、位置、树

1、地图：地图可以是栅格数据，也可以是矢量数据，栅格数据用tiff，矢量数据用shp格式。当使用栅格数据时，要配一个同名的tfw格式文件，来定义它的范围。

2、地点：做一个excel表，包含Site Id，Latitude与Longitude，保存为csv格式

3、序列：新建一个excel表，包含Site Id与Sequence Id，Count，Class,Count为个体数，Class为单倍型类型，保存为csv格式

4、树文件：树文件要用newick格式，分支的名字要用Site Id或Sequence Id，后缀改为gtm。需要用建树的软件生成。

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