多序列比对 (MSA) 是几乎所有比较序列分析的先决条件,guidance是一个强大和用户友好的工具,用于在对齐中为每个残留物、列和序列分配一个置信分数,并将这些分数投影到 MSA。今天分享的是用guidance检测序列比对准确率,一起来看下操作:
#下载软件
http://guidance.tau.ac.il/ver2/overview.php
#安装软件
$ cd /opt/biosoft/guidance.v2.02/
$ make
#检测蛋白序列比对准确性
#检测核酸序列比对准确性
#检测编码序列比对准确性
运行完了,生成以下文件
打开网页版的结果展示,颜色代表可信度,红色可信,蓝色不可信,下方有直方图
Seqs.Orig.fas.FIXED.Removed_Seq为需要删除的序列,可以修改seqcutoff来更改这个结果
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生物软件,会用这个就够了!
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页面更新:2024-03-10
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