他被任命为卫戍区司令，给他配5位政委，受冲击11年后，再任该职

1966年5月，首都工作领导小组成立，组长是叶帅，成员由代总参谋长、公安部长、华北局第一书记、北京市委第一书记、北京军区司令员、政委等人。作为北京军区副司令员的傅崇碧被叫来参加，让他有点儿突然。

叶帅告诉他：卫戍区要扩编，让你兼任卫戍区司令员。

北京卫戍区隶属于北京军区的关系，实际上直接受到总部指挥。

为更好完成保护首都的任务，将卫戍区部队由原来的一个师加一个团，增加到4个师，每一个师有6个团，级别为兵团级。

中央开会时，大军区司令员、政委、省委书记一级到人参加，卫戍司令员、政委也都参加。可见卫戍区的地位，在1966年以后得到很大提升。

卫戍区执掌京畿，主要工作是清理整顿首都治安，保卫党中央的安全。

为了加强领导，卫戍区配了5位政委：第一政委是谢富治，副总理兼任公安部部长；第二政委是北京市第一书记李雪峰，第三政委黄作珍，第四政委刘绍文，第五政委刘福。

在卫戍区的日常工作中，谢富治基本上不参加，毕竟他兼任的职务很多；李雪峰担任该职，更多是挂名而已。毕竟卫戍区在北京市的管辖范围，工作上多少要与地方上有来往，他兼任第二政委，卫戍区与地方的关系协调上更方便一些。而李雪峰的工作重点在华北局、北京市委。

第三政委很重要，负责卫戍区日常工作，上级让傅崇碧提名，毕竟找一个合适的搭档，工作起来更加团结，他提议让黄作珍担任。

黄作珍在到卫戍区之前，担任北京军区政治部副主任，是正军级职务。从工作能力和资历上讲，他能担此重任。把他调来，级别上也提为兵团级了。

由于大运动，卫戍区一直在进行扩编，一度发展到十多万人，为加强政治工作领导，又增补刘绍文、刘福为政委。刘绍文此前担任卫戍区副政委；刘福此前，一直在公安系统工作。

傅崇碧一直在周总理、叶帅的领导下工作，保护着一大批老干部。可是也在运动中受到冲击，被下放到东北7年。1974年，重返北京，担任军区第一副司令员。

1977年，他再次被邓小平任命为卫戍区司令员，此时距离第一次担任该职，过去11年。这是卫戍区唯一一位担任过两次司令员的将领。