Science - 菌群与宿主万年共演化

虽然不同地域或种族的人群的肠道菌群的微生物的种类大体类似，但是富集的菌株类型大相径庭，这种菌株类型的差异从何而来？如何与其宿主关联？(1)

德国马普所Ruth E. Ley 等研究人员就回答了这个问题。通过同时分析1225例来自亚洲、非洲以及欧洲等地区的人基因组及其对应的59种共有的肠道细菌的演化路径（系统发生树分析），研究人员发现其中60%以上的肠道细菌与其宿主有平行的演化路径。进一步，研究人员发现与宿主演化路径平行程度高的细菌呈现适应 “寄生” 的特征，比如缩小的基因组、高比例的必需基因以及对氧浓度与温度更加敏感；而演化平行程度低的细菌呈现类似外界自由生活细菌的特征(1)。

样本来源以及宿主基因组与部分肠道细菌平行演化(1)

与宿主演化平行程度高（PACo effect size数值大）的细菌呈现“寄生”特征(1)

该项工作2022年9月15日发表在Science；研究人员表示该项工作更新了大家对肠道菌群与宿主互作的认识，说明基于菌群的治疗需要考虑人群特点(1, 2)。

Comment(s):

期待随着技术进步，对肠道菌群更系统全面的解析（目前很难分析稀少并且难以培养的微生物），从而更系统了解菌群与宿主的共演化及其功能以及治疗影响。

参考文献：

1. T. A. Suzuki et al., Copersification of gut microbiota with humans. Science (80-. ). 377, 1328–1332 (2022).

2. Gut microbes and humans on a joint evolutionary journey | Max-Planck-Gesellschaft, (available at https://www.mpg.de/19222205/0915-entw-gut-microbes-and-humans-on-a-joint-evolutionary-journey-151730-x).

原文链接：

https://www.science.org/doi/10.1126/science.abm7759