上图是经ChromImpute处理的数据，可以看到，蓝色部分是真实的观察值，红色部分是插值后的结果，经ChromImpute处理后数据的完整性得到了很好的提高，为得到更好的结果提供了保障。

01安装教程

以下是ChromImpute的安装方法：

1. 安装 Java 1.6 或更高的版本

2. 解压缩ChromImpute.zip

3. 解压缩EXAMPLE.zip文件并放到ChromImpute文件夹中

4. 使用cmd命令进入到ChromImpute中

5. 运行以下命令：

计算共需耗时20分钟，在EXAMPLE / OUTPUTDATA文件夹中可以找到名为chr 21_impute_E034_H3K9ac.wig.gz的结果文件。

02操作使用

下面我们再详细介绍一遍在日常的研究中如何使用ChromImpute进行插值：

1.如果输入信号没有达到所需的分辨率（如25bp）,则使用Convert命令将数据转换为所需的分辨率。运行代码如下：

2.数据集之间的全局距离应使用ComputeGlobalDist命令计算。运行代码如下：

3. 使用GenerateTrainData命令可以用于生成训练集。运行代码如下：

java -mx4000M -jar ChromImpute.jar GenerateTrainData EXAMPLE/CONVERTEDDATADIR EXAMPLE/DISTANCEDIR EXAMPLE/tier1_samplemarktable.txt EXAMPLE/hg19sizes_chr21.txt EXAMPLE/TRAINDATA H3K9ac

4.使用Train命令为感兴趣的特定样本类型中的特定标记生成训练后的预测因子。运行代码如下：

5.使用Apply命令为所需样本中的所需标记生成估算信号轨迹。运行代码如下：