如何用SAMOVA对居群分组

SAMOVA是一款群体遗传结构分析软件,可以用来对居群分组等。下面我们就来介绍一具体的使用方法。


操作步骤


准备好取样地点文件如何用SAMOVA对居群分组准备好遗传信息文件,可由dnasp等导出,注意,两个文件名必须一致,只是后缀不同如何用SAMOVA对居群分组运行samova2_console.exe,导入文件,选择数据类型如何用SAMOVA对居群分组选择距离计算方式如何用SAMOVA对居群分组设置gamma值与一些标准参数,再选择分为几组如何用SAMOVA对居群分组SAMOVA2.log为生成的日志文件SAMOVA2_short.log有简明的分组结果如何用SAMOVA对居群分组SAMOVA2_finaltruct_geo.arp为arlequin格式的文件SAMOVA2_finaltruct_geo.res为AMOVA的结果文件如何用SAMOVA对居群分组SAMOVA2_results_geo.htm是分组结果的地图文件
如何用SAMOVA对居群分组以上是均匀考虑地理因素的结果,以下相应的就是不均匀的考虑地理因素的结果。SAMOVA2_finaltruct_nogeo.arpSAMOVA2_finaltruct_nogeo.resSAMOVA2_results_nogeo.htm
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页面更新:2024-04-27

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