疯狂!可改变人类独一无二的DNA,详解CRISPR-Cas9基因编辑技术

2020年10月7日,诺贝尔化学奖被授予德国埃马纽埃尔·沙尔庞捷教授和美国珍妮弗·杜德纳教授,获奖评语如下:以表彰她们发现CRISPR-Cas9“基因剪刀”基因组编辑方法。而随着这一奖项的揭晓,也让人不自觉地将目光投向2018年的“基因编辑婴儿事件”。

疯狂!可改变人类独一无二的DNA,详解CRISPR-Cas9基因编辑技术

2018年11月25日,贺建奎博士宣布,世界首例免疫艾滋病的基因编辑婴儿露露和娜娜在中国诞生,她们都使用CRISPR进行了基因工程。要想了解CRISPR技术,我们首先需要了解DNA,DNA由氮和碳基环组成,形成4个不同的化学代码:腺嘌呤(A)、鸟嘌呤(G)、胞嘧啶(C)、和胸腺嘧啶(T)。

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这些代码形成了一个易于复制的双链分子,以三个一组的形式读取,称为密码子(codon),包含在称为基因的结构中。这些基因只是DNA中编码结构更复杂的蛋白质部分,这些蛋白质反过来又形成了地球上所有生命所需的生物机器和结构。

而贺建奎使用CRISPR-cas9技术改变了露露和娜娜的DNA代码,从而改变了一切。CRISPR-cas9技术,顾名思义,主要依赖于两个关键部分:CRISPR和cas9。CRISPR是1987年由日本科学家石野良纯在细菌DNA中偶然发现的一种重复DNA结构。在这一发现之后的17年里,这些DNA重复序列的作用一直未被发现,直到它被确定为细菌识别和保护自己免受病毒DNA入侵的手段。

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原来,这些DNA重复序列实际上来自病毒。细菌有能力切割入侵的病毒DNA,将其储存在自己的DNA中,然后将其用作在Cas9上,如果病毒将来再次入侵,Cas9会破坏病毒DNA序列。为了做到这一点,Cas9使用存储的DNA制造一种叫做向导RNA(引导核糖核酸)的东西。这种向导RNA通常由CRISPR重复编码,并将CRISPR引导到它应该切割的DNA。

但CRISPR与其目标结合有两个条件。首先Cas9必须结合目标序列和DNA中的特定代码变异,称为PAM(原型间隔区相邻基序)。大多数PAM可以被Cas9识别,因为它们包含代码,这使细菌能够靶向破坏病毒DNA。

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在过去的5年时间里,我们已经学会了利用这种能力来引导Cas9和我们自己设计的向导RNA改变其他生物的基因组。向导RNA与称为Alpha-Helical Lobe的Cas9部分结合。反过来,Cas9的另一个结构域,即核酸酶叶与引导RNA匹配的DNA链中任何侧翼部分结合,导致DNA的双螺旋结构解开。

DNA与Cas9复合物之间的接近度,以及RNA与DNA之间发生的静电相互作用促进了这一过程。此时,核酸酶叶的2个特定结构域切割DNA,这是在DNA的两个位点完成的,一个在目标位点(HNH)切割DNA,另一个在非目标位点(RuvC)切割DNA,在这一点上,可能会发生许多事情,例如修改Cas9会包含一种脱氨酶,该酶可以针对特定碱基进行突变,从而导致全新的突变。

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一种被称为同源定向修复的过程,可用于在切割位点插入新的DNA,或者,简单地切下并移除目标DNA片段。贺建奎选择了后一种选择,从CCR5的基因中切下一段,被切割的部分对应于一种称为delta32的突变,使其不受HIV的影响。

但对人类的遗传密码进行非特异性改变是一个危险信号,正是出于这个原因,贺建奎“基因编辑婴儿事件”在国内外引起了广泛关注,最终贺建奎被他所在大学开除,并被处以罚款和三年监禁……

毫无疑问,CRISPR-Cas9是一个强大的工具,它使基因编辑变得更快、更准确、更便宜、更容易操作,也可以应用于很多方面,包括人类医学、农业和生物燃料等,是一项具有社会颠覆性的技术。

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正如诺贝尔奖得主杜德纳教授所说,我们需要思考这种强大的技术可能带来的广泛影响,还要思考如何以负责任的方式来开发这类技术。而根据世界卫生组织人类基因组编辑(HGE)登记处的数据,截至2020年10月,有115项使用人类基因组编辑技术的临床试验正在进行中,其中包括镰状细胞病和β地中海贫血等分布广泛的遗传疾病。

2020年3月,第一个CRISPR-Cas9基因疗法被施用于患有被称为LCA10的罕见疾病的人,这种疾病会导致儿童失明,目前没有其他治疗方法。在上述情形下,该疗法被用来去除导致这种疾病的基因(CEP290)突变。

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页面更新:2024-03-05

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