4年前没人相信阿里云和华大基因能做成这件事,今天被狠狠打脸

很多企业都热衷于立flag,被打脸的却很多。而今天,阿里云和华大基因却发布了一个重磅,让4年前所有不相信他们的人狠狠打脸。

根据阿里云今天微博发布,他们和华大基因联合,实现了人类精准医疗史上的创举:24小时完成个人全基因组测序。

难度巨大,当时大家都觉得这是“不可能的任务”。

4年前没人相信阿里云和华大基因能做成这件事,今天被狠狠打脸

但阿里云出了名的不按常理出牌,它的建立就是因为所有人都不相信云计算,偏偏王坚信,还做了出来。

因此,阿里云确实有完成这个flag的“基因”。事情的始末是这样的:

2016年阿里云和华大基因宣布合作,计划在24小时内完成全基因组测序。但实际上,在当时,科学界普遍认为至少需要上百个小时才能完成类似流程。

很多人对全基因组测序不太了解。我们简单说明一下原理:

基因是遗传的最小单位,因此破译基因的秘密无异于破解生命的无上奥义。而个人全基因测序(Whole Genome Sequencing,WGS)就是迄今为止最为全面的基因组研究方案,不仅可以检测与人类疾病相关的单核苷酸变异、插入缺失、拷贝数变异和结构变异等多种突变信息,同时还能让人类从根本上知道疾病发生的原因,对如今疑难的遗传病检测、肿瘤筛查都能起到关键作用。

4年前没人相信阿里云和华大基因能做成这件事,今天被狠狠打脸

好莱坞影星安吉丽娜·朱莉就是WGS的受益者。她曾通过WGS检测出其携带了一个“错误”的基因——BRCA1,这就会导致她有87%的几率患乳腺癌,50%的可能患卵巢癌。最终朱莉决定进行乳腺切除手术,将乳腺癌患病风险从87%降到了5%,因此这项技术已经得到越来越多普通人的青睐。

因此,科学家一直在进行着这场伟大而艰巨的探索生命的实验。当1990年首次整个人类基因组被测序公布后,30年来,如何做到速度更快、成本更低就成了新的研究方向。如今相比于第一次测序花费了27亿巨资,一次全基因测序的成本只需要数百美元,就能实现对自己生命的解码。

经过4年心血注入,华大基因在阿里云的强大算力下,只需要15分钟就能完成的基因测序、数据分析环节。据悉,此次重磅消息的实现关键在于阿里云PB级的数据处理能力和容器服务ACK/AGS基因服务,以及赛乐基因GPU加速算法,因此只需要15分钟,7200亿碱基拼装、排序、去重、变异检测就已经运算完成,测试精度高达99.80%,比经典流程快了120倍,比此前全球最快的FPGA/GPU方案也快了4倍之多。

如今从样本处理、测序、数据分析全流程真的只需要24小时就能完成了,也算兑现了4年前所“吹过的牛”!此外,阿里云还和华大基因、英伟达、英特尔不断合作,希望能进一步普及精准医疗。见惯了世间万般疾病的痛苦,我们就更希望这样的技术普及快一点到来,这一天会远吗?欢迎评论讨论。

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页面更新:2024-05-20

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