RNA-seq提供了关于转录组的前所未有的信息,但是利用生物信息学工具来利用这些信息通常是一个瓶颈。这本书的目标是让读者能够分析RNA测序(RNA-seq)数据。详细讨论了几个主题,涵盖了从质量控制、映射和组装到统计测试和路径分析的整个数据分析工作流程。我们的目标不是尽量减少与现有教科书的重叠,而是提供更全面、更实用的演示。
RNA 测序技术就是一霸道总裁把报刊亭里的所有杂志(RNA)全都买回去,然后把所有的杂志全都放进碎纸机里,使其成为一大堆碎纸条,然后由一大帮手下来整理碎纸条(现实生活中的计算机程序开发人员),将碎纸条还原成一本本的杂志。
这本书面向学生和高级研究人员。选择实际例子的方式是,不仅生物信息学家,而且非编程的实验室科学家也可以遵循它们,使这本书适合来自包括生物学、医学、遗传学和计算机科学在内的各种背景的研究人员。这本书可以作为研究生课程、高级研究生课程或暑期学校的教材。它可以作为一个独立的手册,详细概述了中心RNA-seq数据分析方法以及如何在实践中使用这些方法。这本书平衡了理论和实践,所以每一章都从理论背景开始,然后是相关分析工具的描述,以及它们的使用例子。这本书是一个完整的RNA-seq数据分析指南。
这本书使研究人员能够检查基因、外显子和转录物水平的差异表达,并发现新的基因、转录物和完整的转录物。为了与小非编码RNA的重要调节作用保持一致,一整节都致力于它们的发现和功能分析。
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页面更新:2024-04-21
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