13分+,1区Top,JAMA子刊,模型开发测试新思路!性抓紧看过来~

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要说2023年生信最火的分析版块,应该非“临床公共数据库分析”和“孟德尔随机化研究”莫属了吧?

火的原因也是非常现实,那就是实现了生信内卷形势的突破,从常规生信思路中撕出一道口子,拼出了一条光明大道!并且这俩版块还非常适合临床科研人员,现在只靠纯纯的数据挖掘+分析就能快速发高分,就像生信刚开始的红利阶段,所以小云在这里真诚提醒感兴趣的小伙伴千万不要错过这个时机呀!千万不要等着文章数量爆发式增长,后面发文竞争力变大了再上车,那可真就追悔莫及了~ ~

今天分享这篇文章来自1区top JAMA子刊,13分+的NHANES数据库挖掘+分析,联合两大数据库,进行模型开发和验证,分析数据量较大但分析难度不大,这分值,这种杂志级别,对于临床科研人员来说称得上是非常好的评职称文章了,性价比非常高!具体怎么做就跟着小云来一探虚实吧~

(ps:还没有看到小云前面推荐的“临床公共数据库”挖掘文章的朋友,可以点击文末链接查看一下,小云真诚建议不要错过这个发文好途径~)


题目:美国有慢性肾脏疾病风险的成年人蛋白尿的估计患病率和检测

杂志:JAMA Netw Open

影响因子:IF= 13.7998

发表时间:2023年7月


研究背景

蛋白尿检测对于指导循证治疗以减轻慢性肾脏病(CKD)进展和心血管疾病发病率至关重要,但在CKD患者或CKD风险人群中普遍使用不足。该研究旨在使用两步法评估临床医疗系统中非随机检测的蛋白尿检出不足的程度。


研究思路

本研究使用NHANES作为全国代表性样本,建立了一个逻辑回归模型来估计蛋白尿(尿白蛋白/肌酐比值[UACR]≥30 mg/g)。然后将该模型应用于2017年1月1日至2018年12月31日EHR的192 108名活跃门诊患者,来评估在此期间有和没有蛋白尿测试的人群中蛋白尿的发生率。采用多变量逻辑回归分析检验随后一年内进行蛋白尿检测和CKD治疗(包括ACEi或ARB治疗、SGLT2i治疗和血压控制在130/80毫米汞柱或140/90毫米汞柱以下)之间的相关性。


主要结果

1.纳入人群特征

EHR队列共纳入192 108名2017年1月1日至2018年12月31日期间至少有2次门诊就诊的患有高血压或糖尿病的年满18岁成年人(图S1)。基线特征显示,192 108名患者中105 591名(55.0%)为女性,185589人(96.6%)患有高血压,50507人(26.2%)患有糖尿病,平均年龄为60.3 [15.1]岁,eGFR的平均值为84 (21) mL/min/1.73 m2。在纳入的患者中,33629人(17.5%)接受了UACR检测(表1)。


图S1 EHR参与者选择流程图

表1 EHR参与者基线特征


2.基于NHANES的蛋白尿评估模型的开发和评估

作者将13410名NHANES参与者作为开发队列,拟建立一个蛋白尿的评估模型(蛋白尿定义为UACR大于或等于30 mg/g),来应用于EHR研究人群中未经测试患者的蛋白尿患病率评估。作者根据年龄、性别、种族、民族、收缩压、eGFR、糖尿病、冠状动脉疾病和心力衰竭与蛋白尿的既定关联,将其作为自变量拟合成逻辑回归模型。连续变量以样条项建模,以适应非线性关联。

作者计算了 C 指数以评估模型的区分度,并比较了估计的蛋白尿患病率和观察到的患病率以评估校准情况。结果显示,蛋白尿评估模型显示了良好的区分度:NHANES人群的C统计值为0.730 (95% CI,0.719-0.740),应用于EHR亚组进行UACR检验时,C统计值为0.682 (95% CI,0.676-0.688)。为了检查模型在蛋白尿检测率可能不同的亚人群中的可移植性,作者按糖尿病、保险类型和教育水平对模型性能进行了分层评估,并在EHR研究人群中进行UACR测试的亚组中评估模型性能。

结果发现模型校准效果非常好,但在 EHR 数据集中进行 UACR 检测的患者中,模型似乎低估了白蛋白尿患病率 8%-15%(图S3)。

图S3 蛋白尿预测模型的校准图


3.EHR数据集中患者的蛋白尿患病率评估

作者在HER数据集受试患者中,使用大于或等于30 mg/g的UACR测定值来确定蛋白尿的比例。对于未经测试的患者,应用开发的估计模型为每个患者分配一个蛋白尿的概率,蛋白尿的估计患病率被确定为蛋白尿的平均估计概率。蛋白尿的估计总患病率是测试人群和未测试人群中蛋白尿患病率的总和。结果显示,在接受测试的患者中,蛋白尿的真实患病率为34.3%(33629人中的11 525人),而在未接受测试的患者中,蛋白尿的估计患病率为13.4%(158479人中的21 231人)。因此,整个研究人群中蛋白尿的估计患病率为17.1%(192108人中的32 756人),其中只有35.2%(32756人中的11 525人)通过UACR试验检测到(表S5)。在所有人口统计学和共病亚组中,蛋白尿患者的检出率都明显偏低(图1)。检出率最低的是高血压和无糖尿病患者(10.4% [16 681 人中的 1742 人])。


表S5 EHR数据集中患者蛋白尿患病率、检测率和检出率

图1 高血压和/或糖尿病患者的估计蛋白尿患病率和检出比例


4.UACR检测和蛋白尿治疗的关系

在149 554 名患者中研究 UACR 检测与蛋白尿治疗之间的关系,图 2 显示了接受 ACEi 或 ARB 治疗、接受 SGLT2i 治疗以及血压控制在 130/80 毫米汞柱以下或 140/90 毫米汞柱以下的患者比例。在估计蛋白尿风险的每个五分位数中,受试患者总体上更有可能接受ACEi或ARB和SGLT2i治疗。在多变量校正分析中,发现进行UACR检测与接受ACEi或ARB治疗的约2.4倍优势相关(OR,2.39 [95% CI,2.32-2.46]),与接受SGLT2i治疗的8.2倍优势相关(OR,8.22 [95% CI,7.56-8.94]),以及血压控制低于140/90 mm Hg的1.2倍优势相关(OR, 1.20 [95% CI, 1.16-1.23])(表3)。


图2 按蛋白尿估计风险五分位数分列的已检测和未检测患者的治疗情况

表3 尿白蛋白-肌酐比值(UACR)检测与蛋白尿治疗之间的关系


小结

这篇文章利用NHANES数据库开发了一个蛋白尿预测模型,然后在HER队列中进行应用和测试。该文章与常规NHANES数据库分析思路有所不同,2个数据库联用并且还进行了模型开发和测试,创新性较高,所以才仅仅依靠纯公共数据分析就发到13分+的JAMA子刊,这种数据库分析的硬实力毋庸置疑!如果你想在临床数据挖掘方向发高分文章,快来尝试一下这个思路吧!


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页面更新:2024-05-16

标签:孟德尔   毫米汞柱   模型   蛋白尿   测试   检出   高血压   新思路   患者   思路   数据库

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