犹他大学医学院(University of Utah School of Medicine) Jared Rutter等研究人员开发新平台,基于平衡透析和质谱,高灵敏系统分析蛋白与代谢产物的互作(protein-metabolite interactions (PMIs)(1)。
研究人员使用该平台解析了33种碳水化合物代谢相关酶与代谢产物的830项互作,发现该平台可以捕捉已知的蛋白-代谢物互作(酶活调节分子、酶底物以及酶产物等),以及未见报道的新互作(1)。
研究人员最后功能验证了新捕捉的蛋白-代谢产物互作,比如长链脂酰辅酶A(long-chain acyl–coenzyme A)选择性对乳酸脱氢酶(lactate dehydrogenase (LDH))的一种异构体(LDHA)的抑制(1)。
该项工作2023年3月10日发表在Science;研究人员表示该平台可以帮助人们挖掘代谢产物对生物学过程的调控模式,从而回答生物体如何灵活调整能量代谢适应环境等问题(1)。
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该平台的重要优点是灵敏度高,能够捕捉低亲和的互作;不过会面临非特异结合等问题;
此外,毕竟这是体外的系统,并且数据质量很依赖纯化的酶的状态;其捕捉的代谢产物-蛋白互作还是非常需要后续的体内验证。
参考文献:
1. K. G. Hicks et al., Protein-metabolite interactomics of carbohydrate metabolism reveal regulation of lactate dehydrogenase. Science (80-. ). 1003, 996–1003 (2023).
原文链接:
https://www.science.org/doi/10.1126/science.abm3452
页面更新:2024-05-11
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